中亚周边存在的其他一些冲突也造成恐怖分子具有跨国行动的方便条件。与中亚地区相郁的西亚地区一直不平静, 从两伊战争到美国等西方国家时伊拉克、伊朗的打击和制裁, 使外部势力在这个地区有很大影响。中东地区存在的极端主义组织和各种矛盾, 都对中亚地区产生了直接或间接的影响。近年来, 印度和巴基斯坦两国在距离中亚不远的克什米尔地区发生武装冲突, 也破坏了地区的稳定和安全。与中亚国家隔里海相望的外高加索地区以及稍远的俄罗斯北高加索地区,十年来一直被民族冲突和政治动乱所困扰, 纳戈尔诺 一卡拉巴赫、阿布哈兹、车臣等问题悬而未决。而这些冲突地区都有极端主义存在, 而且彼此有联系。据俄罗斯情报部门的消息, 2000年9月初, 来自俄罗斯车臣的非法武装首领哈塔卜也潜入塔吉克斯坦, 参与中亚地区的武装颠覆活动。

　　美国在中亚国家独立以后, 一直忙着推销自己的价值观和政治制度。美国政府认为中亚国家意识形态的混乱是一种进步甚至对中亚国家打击极端主义反对派的作法横加指责。美国谋求的地区“ 安全利益” , 目的并不是针对中亚的极端主义势力, 是想牵制俄罗斯和伊朗在中亚的影响。

　　在1999年中亚国家、中国、俄罗斯等国开始寻求 联合打击极端主义势力时, 美国等西方国家却只关心“ 石油”利益, 极力促成里海石油运输“ 西线”的建设, 造成俄罗斯的不满。欧盟国家对俄罗斯在车臣的军事行动说三道四, 甚至主动要求出面“ 调解”。2000年4月底, 中亚和高加索地区国家经济一体化会议在阿拉木图举行, 俄罗斯和中亚国家的领导人都出席了会议, 哈萨克斯坦总统纳扎尔巴耶夫在会上反对美国在民主问题上采用双重标准, 警告美国不要干涉中亚国家内政。美国和其他西方国家的态度使国际反恐怖阵线没能早一些实现, 致使极端主义来去自由, 恐怖主义在中亚地区无所顾忌地坐大。直到9.11事件爆发后, 美国才猛然醒悟。

　　为了防范和打击极端主义势力, 中亚国家积极推动跨国安全合作, 从1999年开始每年与俄罗斯等国举行‘独联体南方盾牌” 联合军事演习；2000年4月, 哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦和乌兹别克斯坦在塔什干签署了关于打击恐怖主义、政治和宗教极端主义、跨地区有组织犯罪和其他威胁地区稳定和安全行为的条约。

　　1996年4月, 中国、俄罗斯与中亚的哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦五国元首在上海举行峰会, 建立“ 上海五国”首脑会晤机制。今年6月“上海合作组织”成立, 哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦和乌兹别克斯坦与中国、俄罗斯一同签署了打击“三般势力”的《上海公约》。中亚国家还严刑峻法, 打击国内的极端分子, 乌兹别克斯坦在1999年审判了参与塔什千爆炸事件的恐怖分子,六名首犯被处以极刑；2001年1月, 塔吉克斯坦判处14名宗教极端组织成员8—18年徒刑。